NGS Built For You

INVIEW Microbiome 16S Volllängen
Nanopore Sequenzierung

INVIEW Microbiome 16S-Volllängen "Long-Read" Nanopore Sequenzierung

Mikrobiomanalyse oder Community-Analyse mit 16S-rRNA-Vollständigkeitssequenzierung unter Verwendung der Oxford-Nanopore-Sequenzierungstechnologie. Höhere taxonomische Auflösung durch Sequenzierung des gesamten 16S-rRNA-Gens.

>> Angebot/ Bestellung

Barcodes bestellen

Industrieoptimiert

Anwendungen

Charakterisierung von Stämmen oder Gemeinschaften
Identifizierung des taxonomischen Hintergrunds
Metagenomische Analyse von Lang-Lese-Sequenzen

Gold Standard oder Premium

Hohe taxonomische Auflösung
Keine Analyse der Komponeten (PCA) durch den Kunden notwendig

>> FAQ's Nanopore

>> Proben- vorbereitung

Produktspezifikationen

Produktbeschreibung

Bibliotheksvorbereitung

PCR-Verstärkung mit Primerpaaren 27F und 1492R
ONT-Bibliotheksvorbereitung unter Verwendung von nativem Barcode + Adapterligation (bis zu 96 Proben)
Sequenzierung

Technologie: Oxford Nanopore

Ausgaberead-Länge: Entsprechend der Fragmentlänge (für das vollständige 16S-rRNA-Gen ca. 1500 bp)
Datenoutput: Ungefähr 7 Gb pro Flow-Zelle (abhängig von der DNA-Qualität und -länge)

Lieferumfang

Rohdaten der Nanopore-Sequenzierung (FastQ)
Bakterielle Zusammensetzungsprofile (OTU-Tabellen)

Probenanforderungen

DNA-Proben mit > 2,5 ng/μl in 20 μl.

Um den Versand von Proben mit potenziellen Verunreinigungen zu vermeiden, überprüfen Sie bitte die Absorptionsverhältnisse der Probe mit einem Spektrophotometer, z. B. Nanodrop:

OD 260/280: ~1.8
OD 260/230: 2.0-2.2

Ihre Meinung ist wichtig

Aktuell bieten wir nur vollständige GridION-Flow-Cells an. Diese Option ist am kostengünstigsten, wenn Sie viele Proben haben. Wir evaluieren die Erweiterung unseres Services und möchten wissen, was Ihnen am wichtigsten ist:

Preisgestaltung - Ich möchte einzelne Proben zu einem attraktiven Preis einsenden. Eine längere Bearbeitungszeit (z. B. 4 Wochen) wäre kein Problem.
Bearbeitungszeit (TAT) - Für meine Studien ist eine kurze Bearbeitungszeit absolut entscheidend.
Flexibilität - Manchmal habe ich ein paar Proben, die nicht dringend sind, und ich kann länger warten. Es kann aber auch vorkommen, dass ich meine Ergebnisse wirklich schnell benötige und bereit wäre, einen Premium-Preis zu zahlen.
Keines der oben genannten? Dann hinterlassen Sie bitte einen Kommentar.