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INVIEW OncoRNAfusion

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  • INVIEW OncoRNAfusion
 

 

INVIEW OncoRNAfusion - Erkennung von 107 für Krebs relevante RNA-Fusionsgenen.



RNA-Sequenzierung (RNA-Seq) dringt in den Bereich der Präzisionsmedizin und der klinischen Versorgung vor und ist bereits ein wichtiger diagnostischer und prognostischer Parameter bei verschiedenen Krebsarten.

 

INVIEW OncoRNAfusion - 107 wurde entwickelt, um Fusionsereignisse ausgewählter Gene zu erkennen, die zuvor anfällig für Fusionen waren und mit Krebs in Verbindung gebracht wurden.

 

RNA aus Gewebe oder FFPE wird in cDNA umgekehrt transkribiert und anschließend einem Anreicherungsprozess unterzogen.

 

 

>> Angebot/ Bestellung

Barcodes bestellen

Industrieoptimiert

 


Anwendungen

 

  • Erkennung bekannter tumorassoziierter Fusionsereignisse von 107 ausgewählten Genen
  • Erkennung neuer Fusionsereignisse, wobei ein Fusionspartner eines der 107 ausgewählten Gene sein muss

 


Klinische Anwendungen

 

  • Molekulare Stratifikation
  • Unterstützung bei Therapieentscheidungen
  • Zuweisung von Patienten zu klinischen Studien
  • Nachsorge nach der Behandlung, insbesondere zur Überwachung von mehreren Mutationen

 

Besonderheiten

 

  • Anreicherung von 107 Genen, die anfällig für Fusionsereignisse sind
  • Sehr kosteneffizient
  • Optional flexible Sequenziertiefe zur Erkennung schwach exprimierter Gene
  • Individuelle Chargengröße ab einer Probe
 

 

>> FAQ's Oncornafusion

>> Proben- vorbereitung

>> onkologie lösungen

 

 

 

 

Produktspezifikationen

 

 

Onkologie Produktauswahl

Je nach Projektziel können Sie das für Sie am besten geeignete INVIEW-Produkt auswählen:


INVIEW Exom
Exom zur Detektion von Mutationen innerhalb exomischer Regionen

Wenn Sie mit flüssigen Biopsieproben / zellfreier DNA arbeiten, empfehlen wir das INVIEW Liquid Biopsy Oncoexom.

 


Klinisches Forschungsexom CRE V4

CRE V4 zur Detektion von Mutationen innerhalb exonischer Regionen sowie ausgewählter nicht-codierender Regionen und vieles mehr.



INVIEW Oncoprofiling

Oncoprofiling für kostengünstige Detektion von Mutationen in 728 ausgewählten Genen im Zusammenhang mit Krebs.



Wenn Sie mit flüssigen Biopsieproben / zellfreier DNA arbeiten, empfehlen wir das INVIEW Liquid Biopsy Oncoprofiling.

 


INVIEW OncoRNAfusion

OncoRNAfusion zur kostengünstigen Detektion von Fusionsereignissen, die 107 Gene betreffen, die anfällig für Fusionsereignisse sind.

Akzeptiertes Ausgangsmaterial

 

Akzeptiertes Ausgangsmaterial

  • Gesamt-RNA aus verschiedenen Quellen
  • rRNA-depletierte Gesamt-RNA
  • Menge: empfohlen: 300 ng für frisch gefrorenes Material (400 ng für FFPE-Proben)
  • Gelöst in RNase-, DNase- und Protease-freiem Tris-HCL-Puffer (pH 7,5 bis pH 8,0)


Akzeptiertes Ausgangsmaterial für die RNA-Isolierung

  • Gewebe
  • Zellen
  • Körperflüssigkeiten
  • FFPE-Gewebe

 

Bitte beachten Sie, dass nur Material der S1-Klassifizierung für die online bestellte RNA-Isolierung akzeptiert wird. Weitere Informationen zur aktuellen Klassifizierung biologischen Materials finden Sie hier (TRBA 466). Bitte kontaktieren Sie uns für weitere Informationen zur Isolierung von RNA aus Material, das als S2 klassifiziert ist

 

Bibliothekenherstellung und Anreicherung

  • Erste und zweite Strangsynthese
  • Adaptor-Ligation und Indizierung
  • Hybridisierung zur Anreicherung der ZielsequenzenAmp
  • lifikation der angereicherten DNA-Fragmente
  • Qualitätskontrolle und Pooling der finalen Bibliotheken

Sequenzierung

  • Technologie: Illumina
  • Run Modus: 2 x 150 bp
  • Datenmenge: 5 M Read Paare pro Probe (mehr Daten sind möglich) (+/- 3%)

Bioinformatische Analyse


Bioinformatische Analyse

  • Sequenzqualitätskontrolle
  • Mapping & Alignment
  • Erkennung von Genfusionsereignissen
  • Variantenaufruf


Liefergegenstände

  • FastQ-Dateien (Sequenzen und Qualitätsbewertungen)
  • Alignierungsdatei (bam)
  • Tabelle potenzieller RNA-Fusionen
  • Liste potenzieller Sequenzvarianten
  • Zusammenfassender Berich

 

 
 

 

 

 

 

 

 

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