Eurofins Genomics verwendet ein Basecalling-Programm, dass jeden Peak jeder Base einzeln untersucht und anhand dessen an jede Base einen Qualitätswert (Q) vergibt. Qualitätswerte variieren im Bereich von 4 bis ca. 60, je höher der Wert, desto höher die Qualität.
Die Qualitätswerte haben einen logarithmischen Bezug zu Fehlerwahrscheinlichkeiten in der Sequenz. Eine Aufstellung sehen Sie in folgender Tabelle:
Qualitätswert | Wahrscheinlichkeit einer falsch gelesenen Base | Sequenzgenauigkeit |
Q 10 |
1 in 10 |
90 % |
Q 20 |
1 in 100 |
99 % |
Q 30 |
1 in 1.000 |
99.9 % |
Q 40 |
1 in 10.000 |
99.99 % |
Q 50 |
1 in 100.000 |
99.999 % |