Die erforderliche Anzahl an Reads hängt von Faktoren wie der Größe des Genoms, der Anzahl der bekannten Gene und Transkripte ab. Als allgemeine Richtlinie empfehlen wir:
- 5-10 Millionen Read-Paare pro Probe für kleine Genome (z.B. Bakterien)
- 20-30 Millionen Reads pro Probe für größere Genome (z.B. Mensch, Maus)
- Für mittelgroße Genome (z.B. Hefe) kann die erforderliche Anzahl an Reads je nach Projekt variieren, aber typischerweise schlagen wir 15-20 Millionen Reads pro Probe vor.
- Für de novo Transkriptom-Assemblierungsprojekte empfehlen wir etwa 100 Millionen Reads pro Probe.