Wir stellen Rohdaten als FASTQ-Dateien für alle Projekte zur Verfügung. Darüber hinaus bieten wir fortgeschrittene bioinformatische Dienstleistungen an, die optional zur Datenanalyse genutzt werden können. Die verfügbaren bioinformatischen Dienstleistungen für RNA-Seq-Projekte sind wie folgt:
Standardanalyse:
- Qualitätsbewertung der Sequenzierungsdaten
- Ausrichtung der Reads auf ein Referenzgenom
- Assemblierung und Quantifizierung von Transkripten
- Normalisierung der Genanzahl
- Identifizierung von unterschiedlich exprimierten Genen
- Hauptkomponentenanalyse (PCA)
- Signifikanztests
- Erstellung detaillierter Berichte und Visualisierungen
Optionale Analyse:
- Analyse des alternativen Spleißens (AS)
- Genfusion-Analyse
- Varianten-Erkennung und deren Auswirkungen auf Proteinveränderungen
Erweiterte Analyse:
- Gen-Set-Anreicherungsanalyse (GSEA)
Jeder Service umfasst spezifische Ergebnisse und hat damit verbundene Kosten und Bearbeitungszeiten.