Die Schmelztemperatur TM charakterisiert die Stabilität eines DNA-Hybrids, das von einem Oligo und seinem komplementären Strang gebildet wird. Bei TM 50% bindet ein Oligo an seinem komplementären Strang.
Nutzen Sie unser Oligo Analyse Tool zur Berechnung der Schmelztemperatur. Ansonsten können folgende Formeln verwendet werden:
Sequenz < 15 Basen
TM [°C] = 2(nA + nT) + 4(nG + nC)
Sequenz > 15 Basen
TM [°C] = 69.3 + [41(nG + nC) / s – (650 / s)]
n = Anzahl des Nukleosids X
s = Menge aller Nukleoside der Sequenz
Beispiel:
Sequenz: GAA ATG AGT GCT CAT CAC TAC TTC CGC (27mer)
nA=7; nC=8; nG=5; nT=7 s= 27
Sequenz < 15 Basen
TM [°C] = 2(7 + 7) + 4(5 + 8) = 80.0
Sequenz > 15 Basen
TM [°C] = 69.3 + [41(5 + 8) / 27] – (650 / 27) = 69.3 + 19.7 – 24.0 = 65.0